ارزیابی عمل ژن و هتروزیس صفات کمی در برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از طرح تلاقی کارولینای شمالی III

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشیار مؤسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران

2 استادیار مؤسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران

چکیده

مقدمه
با توجه به تقاضای آتی برنج، به عنوان غذای مورد نیاز انسان، تولید ارقام جدیدی که عملکرد آن‎ها از ارقام موجود فراتر رود ضروری است. موفقیت در هر برنامه اصلاحی به انتخاب ژنوتیپ‌های مناسب به عنوان والدین در برنامه تلاقی بستگی دارد. تخمین پارامترهای ژنتیکی از جمله وراثت‌پذیری، عملکرد ژن و ارتباط بین صفات به منظور تدوین سودمندترین روش اصلاحی، بسیار مهم است. برای برآورد تنوع ژنتیکی و اجزای واریانس از طرح‌های تلاقی مختلف مانند طرح‌های کارولینای شمالی I ، II و III استفاده می‌شود. این پژوهش به منظور ارزیابی هتروزیس، پارامترهای ژنتیکی، عملکرد ژن و وراثت‌پذیری صفات کمی مهم در برنج با استفاده از طرح تلاقی کارولینای شمالی III انجام شد.
مواد و روش‌ها
در این تحقیق از دو رقم دیلمانی و گیلانه با توجه به نتایج حاصل از پژوهشی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره، برای تلاقی به روش طرح سوم کارولینای شمالی استفاده شد. پس از انجام تلاقی‌های مورد نظر، نتاج به‌دست‌آمده از طرح تلاقی کارولینای شمالی به همراه والدین آن‌ها در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار کشت شد. قبل از ارزیابی، بوته‌های خارج از تیپ حذف، سپس میانگین مشاهدات در هر کرت برای تجزیه‌های آماری مورد استفاده قرار گرفتند. برای تجزیه و تحلیل واریانس و برآورد پارامترهای ژنتیکی NCIII از نرم افزارهای SPSS و Excel استفاده شد.
یافته‌ها
برآورد واریانس‌های افزایشی و غالبیت نشان‌دهنده وجود اثرات افزایشی و غیرافزایشی در کنترل ژنتیکی صفات عملکرد دانه، وزن صد دانه، ارتفاع بوته، تعداد خوشه در هر بوته، تعداد خوشه‌چه در هر خوشه، طول خوشه و تعداد دانه پر در هر خوشه بود. در صفات ارتفاع بوته، تعداد خوشه در هر بوته و تعداد دانه پر در هر خوشه، اثرات غیرافزایشی نقش مهمی داشتند. در صفات عملکرد دانه، وزن صد دانه، ارتفاع بوته، تعداد خوشه در هر بوته، تعداد خوشه‌چه در هر خوشه، طول خوشه و تعداد دانه پر در هر خوشه، پدیده فوق غالبیت مشاهده شد. در صفت عملکرد دانه، محدوده هتروزیس بین 64/12- درصد برای تلاقی F2 No. 1 × گیلانه تا 5/38 درصد برای تلاقی F2 No. 11 × دیلمانی بود. برای ارتفاع بوته، بیشترین هتروزیس نسبی بر اساس میانگین والدین برای کاهش ارتفاع بوته، در تلاقی F2 No. 9 × دیلمانی (4/11- درصد) دیده شد.
نتیجه‌گیری
نتایج حاصل از این پژوهش نشان‌دهنده وجود اثرات افزایشی و غیرافزایشی در کنترل ژنتیکی صفات عملکرد دانه، وزن صد دانه، ارتفاع بوته، تعداد خوشه در هر بوته، تعداد خوشه‌چه، طول خوشه و تعداد دانه پر در هر خوشه است. از طرف دیگر در کنترل ژنتیکی صفات عملکرد دانه، وزن صد دانه، تعداد خوشه‌چه در هر خوشه و طول خوشه، اثرات افزایشی نقش بیشتری داشتند. با این حال، در کنترل ژنتیکی عملکرد دانه، وزن صد دانه، تعداد خوشه‌چه و طول خوشه، علاوه بر اثرات افزایشی، اثرات غیرافزایشی نیز دخالت داشتند. همچنین بررسی هتروزیس حاکی از وجود نتاج برتر از والدین در صفات مورد بررسی و امکان استفاده از آن‎ها در برنامه‌های اصلاحی بود.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Assessing gene action and heterosis for quantitative traits in rice (Oryza sativa L.) through North Carolina III mating design

نویسندگان [English]

  • Mehrzad Allahgholipour 1
  • Alireza Haghighi Hasanalideh 2
1 Associate Professor of Rice Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Rasht, Iran
2 Assistant Professor of Rice Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Rasht, Iran
چکیده [English]

Introduction
Due to the future demand for rice, as a food required by humans, it is necessary to produce new cultivars whose yield exceeds the existing cultivars. Success in any breeding program depends on selecting appropriate genotypes as parents in the crossing program. Estimating genetic parameters such as heritability, gene effect, and the relationship between traits is fundamental to developing the most beneficial breeding method. Various mating designs such as the North Carolina I, II, and III designs are used to estimate genetic diversity and variance components. This study was performed to evaluate heterosis, genetic parameters, gene effect, and heritability of important quantitative traits in rice using the North Carolina III mating design.
materials and methods
In this study, two cultivars, Deylamani and Gilaneh, were used for the North Carolina III mating design according to the results of a study using microsatellite markers. After the crosses were performed, the progenies from the North Carolina III mating design were planted with their parents in a randomized complete block design with three replications. Prior to evaluation, off-type plants were removed, and then the mean of observations per plot was used for statistical analysis. SPSS and Excel softwares were used to analyze variance and estimate NCIII genetic parameters.
Results
Estimation of additive and dominance variances indicated the presence of additive and non-additive effects in genetic control of grain yield, 100-grain weight, plant height, number of panicles per plant, number of spikelet per panicle, panicle length, and number of filled grains per panicle. Non-additive effects played an essential role in plant height, the number of panicles per plant, and the number of filled grains per panicle. The overdominance phenomenon was observed in grain yield, 100-grain weight, plant height, number of panicles per plant, number of spikelet per panicle, panicle length, and number of filled grains per panicle. In grain yield, the range of heterosis was -12.64% for the cross of F2 No. 1 × Gilaneh up to 38.5% for the cross of F2 No. 11 × Deylamani. For plant height, the highest relative heterosis based on the average parent to reduce plant height was seen at the cross of F2 No. 9 × Deylamani (-11.4%).
Conclusion
The results of this study indicate the existence of additive and non-additive effects in genetic control of grain yield, 100-seed weight, plant height, number of panicles per plant, number of spikelets, panicle length, and filled grain number per panicle. On the other hand, in genetic control of grain yield, 100-grain weight, number of spikelets per panicle, and panicle length, additive effects had a greater role. However, in addition to additive effects, non-additive effects were also involved in genetic control of grain yield, 100-grain weight, number of panicles, and panicle length. The study of heterosis also showed the existence of superior offspring in the studied traits and the possibility of using them in breeding programs.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Genetic effect
  • Heritability
  • Heterosis
Acquaah, G. 2009. Principles of plant genetics and breeding. John Wiley & Sons.
Allahgholipour, M., Farshadfar, E., & Rabiei, B. 2014. Molecular characterization and genetic diversity analysis of different rice cultivars by microsatellite markers. Genetika, 46 (1), 187-198. https://doi.org/10.2298/GENSR1401187A
Bainade, P. S., Manjare, M. R., Deshmukh, S. G., & Kumbhar, S. D. 2014. Genetic analysis in green gram (Vigna radiata (L.) Wilczek) subjected to North Carolina mating design-I. The Bioscan, 9 (2), 875-878.
Comstock, R. E., & Robinson, H. F. 1952. Estimation of average dominance of genes. Heterosis, 2, 494-516.
Dan, Z., Hu, J., Zhou, W., Yao, G., Zhu, R., Huang, W., & Zhu, Y. 2015. Hierarchical additive effects on heterosis in rice (Oryza sativa L.). Frontiers in plant science, 6, 738. https://doi.org/10.3389/fpls.2015.00738
de Morais, O. P., Pereira, J. A., Melo, P. G. S., Guimarães, P. H. R., & de Morais, O. P. 2017. Gene action and combining ability for certain agronomic traits in red rice lines and commercial cultivars. Crop Science, 57 (3), 1295-1307. https://doi.org/10.2135/cropsci2015.11.0687
Devi, B. 2017. Magnitude of heterosis in some inter-Varietal crosses of Rice (Oryza sativa L.). Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry, 6 (2), 327-330.
Fonseca, S., & Patterson, F. L. 1968. Hybrid vigor in a seven‐parent diallel cross in common winter wheat (Triticum aestivum L.). Crop Science, 8 (1), 85-88. https://doi.org/10.2135/cropsci1968.0011183X000800010025x
Gahtyari, N. C., Patel, P. I., Choudhary, R., Kumar, S., Kumar, N., & Jaiswal, J. P. 2017. Combining ability studies for yield, associated traits and quality attributes in rice for South Gujarat (Oryza sativa L.). Journal of Applied and Natural Science, 9 (1), 60-67. https://doi.org/10.31018/jans.v9i1.1151
Hadini, H., Nasrullah, N., Taryono, T., & Basunanda, P. 2015. Estimates of genetic variance component of an equilibrium population of corn. AGRIVITA, Journal of Agricultural Science, 37 (1), 45-50. https://doi.org/10.17503/Agrivita-2015-37-1-p045-050
Haghighi Hasanalideh, A., Farshadfar, E., & Allahgholipour, M. 2017. Genetic parameters and combining ability of some important traits in rice (Oryza sativa L.). Genetika, 49 (3), 1001-1014. https://doi.org/10.2298/GENSR1703001H
Hallauer, A. R., Carena, M. J., & Miranda Filho, J. D. 2010. Quantitative genetics in maize breeding (Vol. 6). Springer Science & Business Media.
He, Q., Zhang, K., Xu, C., & Xing, Y. 2010. Additive and additive× additive interaction make important contributions to spikelets per panicle in rice near isogenic (Oryza sativa L.) lines. Journal of Genetics and Genomics, 37 (12), 795-803. https://doi.org/10.1016/S1673-8527(09)60097-7
Kader, M. A., Patwary, A. K., Hossain, M. M., & Majumder, R. R. 2015. Study on heterosis of some experimental hybrids in rice. Scientia Agriculturae, 12 (3), 135-143. https://doi.org/10.15192/PSCP.SA.2015.12.3.135143
Khush, G. S. 2013. Strategies for increasing the yield potential of cereals: case of rice as an example. Plant Breeding, 132 (5), 433-436. https://doi.org/10.1111/pbr.1991
Kumar, S., Singh, N. K., Kumar, R., Singh, S. K., Nilanjaya, C. K., & Kumar, A. 2017. Heterosis studies for various morphological traits of rice under drought conditions. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences, 6 (10), 507-521. DOI: https://doi.org/10.20546/ijcmas.2017.610.062
Li, L., He, X., Zhang, H., Wang, Z., Sun, C., Mou, T., Li, X., Zhang, Y., & Hu, Z. 2015. Genomewide mapping reveals a combination of different genetic effects causing the genetic basis of heterosis in two elite rice hybrids. Journal of genetics, 94 (2), 261-270. https://doi.org/10.1007/s12041-015-0527-8
Makwana, R., Patel, V., Pandya, M., & Chaudhari, B. 2018. Inferences on magnitude and nature of gene effects for morpho-physiological traits in rice (Oryza sativa L.). International Journal of Pure and Applied Bioscience, 6, 1488-1493. http://dx.doi.org/10.18782/2320-7051.5530
Nayak, P., Sreedhar, M., SurenderRaju, C., & Vanisree, S. 2016. Heterosis and gene action studies involving aromatic lines for grain quality traits in rice. International Journal of Life Sciences, 4 (4), 517-528.
Nugraha, Y., Ardie, S. W., Ghulamahdi, M., Suwarno, S., & Aswidinnoor, H. 2016. Implication of gene action and heritability under stress and control conditions for selection iron toxicity tolerant in rice. AGRIVITA, Journal of Agricultural Science, 38 (3), 282-295. https://doi.org/10.17503/agrivita.v38i3.740
Nuruzzaman, M., Alam, M. F., Ahmed, M. G., Shohael, A. M., Biswas, M. K., Amin, M. R., & Hossain, M. M. 2002. Studies on parental variability and heterosis in rice. Pakistan Journal of Biological Sciences, 5, 1006-1009. https://doi.org/10.3923/pjbs.2002.1006.1009
Patil, P. P, Vashi, R. D., Lodam, V. A, Patil, S. R., & Patil, S. S. 2012. Combining ability for yield and component characters in rice (Oryza sativa L.). Agricultural Science Digest, 32 (1), 28-32.
Pradhan, S. K., & Singh, S. 2008. Combining ability and gene action analysis for morphological and quality traits in basmati rice. ORYZA-An International Journal on Rice, 45 (3), 193-197.
Priyanka, K., & Jaiswal, H. K. 2017. Heterosis studies for yield and yield related traits over seasons in boro rice. International Journal of Pure and Applied Bioscience, 5 (6), 1000-1009. http://dx.doi.org/10.18782/2320- 7051.5154
Rahaman, A. 2016. Study of nature and magnitude of gene action in hybrid rice (Oryza sativa L.) through experiment of line x tester mating design. International Journal of Applied Research, 2 (2), 405-410.
Raju, N. S., Senguttuvel, P., Prasad, A. H., Beulah, P., Naganna, P., Ali, S., & Rao, K. 2017. Combining ability and heterosis prediction for grain yield of parental lines and hybrids for heat tolerance in rice (Oryza sativa L.). Agriculture update, 12, 1213-1221. https://doi.org/10.15740/HAS/AU/12.TECHSEAR(5)2017/1213-1221
Ray, B. P., Sarker, M. & Saha, S. 2014. Combining ability and heterosis in inter-ecotypic classes of rice (Oryza sativa L.). Bulletin of the Institute of Tropical Agriculture, Kyushu University, 37 (1), 27-39.
Shabbir, G., Husnain, S., Mehdi, S. M., & Ehsan, M. 2017. Combining ability studies in rice through 6 × 6 diallel cross analysisJournal of Agricultural Research, 55 (4), 591-600.
Sharma, R. K., & Mani, S. C. 2008. Analysis of gene action and combining ability for yield and its component characters in rice. ORYZA-An International Journal on Rice, 45 (2), 94-97.
Shen, G., Zhan, W., Chen, H., & Xing, Y. 2014. Dominance and epistasis are the main contributors to heterosis for plant height in rice. Plant Science, 215, 11-18. https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2013.10.004
Shobhana, V. G., Ashokkumar, K., Karthikeyan, A., Kumar, R. N., Sheeba, A., & Vivekanandan, P. 2018. Heterosis analysis for yield in hybrids involving new plant type and indica lines of rice (Oryza sativa L.). International Journal of Chemical Studies, 6 (3), 3043-3049.
Soni, S. K., Yadav, V. K., Bhadana, V. P., Yadav, M. C., & Sundaram, R. M. 2017. Prediction of heterosis using hypervariable microsatellite markers in tropical japonica× indica rice hybrids. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences, 6 (10), 1419-1427.
Tejaswini, K. L. Y., Kumar, B. R., Mohammad, L. A., Raju, S. K., Srinivas, M., & Rao, P. R. 2016. Study of genetic parameters in F5 families of rice (Oryza sativa L.). International Journal of Environment, Agriculture and Biotechnology, 1 (4), 238592. https://doi.org/10.22161/ijeab/1.4.17
Wen, J., Zhao, X., Wu, G., Xiang, D., Liu, Q., Bu, S. H., Yi, C., Song, Q., Dunwell, J. M., Tu, J., Zhang, T., & Zhang, Y. M. 2015. Genetic dissection of heterosis using epistatic association mapping in a partial NCII mating design. Scientific Reports, 5 (1), 18376. https://doi.org/10.1038/srep18376
Zhou, H., Xia, D., Zeng, J., Jiang, G., & He, Y. 2017. Dissecting combining ability effect in a rice NCII-III population provides insights into heterosis in indica-japonica cross. Rice, 10 (1), 39. https://doi.org/10.1186/s12284-017-0179-9